Член-кореспондент Національної академії медичних наук України, професор, заслужений діяч науки і техніки України, завідувач кафедри діабетології Національного університету охорони здоров'я України імені П. Л. Шупика. Працював у провідних університетах світу – Північно-Західному університеті (Чикаго, США), Університеті Майямі (США), Національному Інституті цукрового діабету (Дюссельдорф, Німеччина). Голова правління Української діабетологічної асоціації.
Є членом Президії робочої групи з вивчення діабетичної нейропатії Європейської асоціації з вивчення цукрового діабету. Є головним редактором журналу «Діабет Ожиріння Метаболічний синдром», членом редакційних колегій журналів «Journal of Diabetes Science and Technology» (США), «International Journal of Biomedicine» (США), «Проблеми ендокриної патології», «Міжнародний ендокринологічний журнал». Рецензент статей у провідних міжнародних журналах – Diabetes Care, Diabetes, Journal of Diabetes Science and Technology та вітчизняних наукових видань.
Б. М. Маньковський є автором понад 700 наукових публікацій, у тому числі більше 200 опубліковані в міжнародних виданнях, 10 монографій, з яких 2 опубліковані за кордоном (Канада, США). Наукові інтереси Б. М. Маньковського пов'язані з вивченням механізмів розвитку і розробкою методів лікування ускладнень цукрового діабету, таких як діабетична нейропатія, гострі і хронічні порушення церебрального кровообігу.